中国科学院为调整和加强神经科学研究力量，1999年11月在上海正式建立神经科学研究所。2014年依托研究所成立“中国科学院脑科学卓越创新中心”，是中科院首批4个卓越中心之一；2015年6月扩展为“中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心”，成为国际上第一个脑科学与类脑研究交叉融合的科研机构。所长蒲慕明教授是国际著名的神经科学家，在国际神经科学界享有很高的威望。他是神经轴突生长和突触可塑性研究的国际权威，其研究工作在Nature 、Science杂志上发表论文三十几篇。研究所的任务是开展神经科学前沿领域研究，力争取得国际一流的研究成果和培养优秀人才。为此，研究所从国内外招聘优秀的年轻科学家，并为他们提供高强度的研究支撑。研究所建立新的体制和运行机制，提供：（1）严谨的和有利于相互切磋的学术环境；（2）有利于科研人员获得重要科研成果的管理和支撑系统；（3）以业绩为标准的晋升和资助体系；（4）培育高质量年轻一代神经科学研究人员的制度与环境。 中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）已组建了38个研究组，获聘的研究组长可得到接近国际水平的研究启动费及稳定的科研经费。研究所为研究人员提供研究分子、细胞和系统神经生物学的各类先进仪器装备。 中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）的主要研究领域：分子和细胞神经生物学，发育神经生物学，系统、计算和认知神经科学及神经系统疾病。 中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）已在Science、Nature、Cell、 Nature Neuroscience、 Nature Cell Biology、 Neuron、 PNAS.、 The Journal of Cell Biology、J. Neuroscience等国际一流学术刊物发表一系列重要成果。 * 《基于体细胞核移植技术成功克隆出猕猴》入选2018年中国科学十大进展 * 《构建出世界首个非人灵长类自闭症模型》入选2016年中国科学十大进展 * 《神经疾病靶点研究》荣获2015年中国科学院“十二五”标志性重大进展 * 《神经突触形成新机制的研究》荣获2014年国家自然科学二等奖 * 《星形胶质细胞多巴胺D2受体通过αB晶状体球蛋白抑制神经炎症》入选2013年中国科学十大进展 * 《神经发育与可塑性研究集体》荣获2011年中科院杰出科技成就奖 * 《胶质细胞新功能的研究》荣获2010年国家自然科学二等奖 * 全国百篇优秀博士学位论文奖9名 * 中科院优秀博士学位论文奖27名 * 上海市研究生优秀成果（学位论文）21名 * 吴瑞奖学金10名 * 中科院院长特别优秀奖17名、优秀奖31名